中医药方法治疗肛肠疾病有非常悠久的历史，较早的记载可见于《黄帝内经》，至今，传统的结扎疗法、挂线疗法仍然被认为是复杂性痔瘘不可替代的方法，目前临床治疗肛肠疾病的许多术式由此衍生和发展，中医肛肠科被认为是最具中医特色的学科之一，在肛肠疾病的诊疗中作出了宝贵贡献。

    一个世纪以来，中医肛肠学科建设取得了长足进步，作为普通外科的一个分支，完成了一级分科，国内诸多医院的肛肠科实现了二级三级分科，中医特色制剂的运用、中西医结合术式改良、围手术期级术后中医药参与，减轻了病人的痛苦，提高了远期疗效。中华中医药学会肛肠分会制定的《肛肠疾病的诊疗规范》为肛肠疾病的诊断与治疗提供了行业标准。建国以后，各级中医医院肛肠科和著名的全国中医肛肠医疗中心的设置，使中医肛肠科的影响力与日俱增。

    中医药方法在肛肠病诊疗中的特色与优势在于与人为本，以改善患者生活质量为目标，最大限度地维护肛门自制功能，较好解决了术后肛门坠胀、肠液外漏、狭窄、失禁、疼痛等并发症，如切开挂线、切开旷置在外科难治性疾病－高位肛瘘、直肠周围脓肿治疗中的成功运用。

    中医药促进愈合、中西医结合术式改良、疑难性肛肠病的一期手术等研究在近50年间取得了较大进展。南通市中医院肛肠科在继承和发扬中医药在肛肠科的运用方面做了很多努力，也因此确立了中医肛肠科在南通肛肠领域的中心地位。